Номенклатура HLA системы и открытие новых аллельных вариантов в казахской популяции

Аннотация

Система человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA) является одной из наиболее генетически полимерфных в организме человека, которая включает более 220 генов, кодирующих иммунные белки, играющие ключевую роль в трансплантационной совместимости, регуляции иммунного ответа и предрасположенности к заболеваниям. В данном обзоре представлены основы номенклатуры HLA, стандартизированной Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) и поддерживаемой в базе данных IPD-IMGT/HLA. Описана эволюция методов типирования HLA - от серологических тестов до молекулярных технологий, включая секвенирование по Сэнгеру и секвенирование нового поколения (NGS), а также использование специализированного программного обеспечения для интерпретации данных. Проведена оценка их преимуществ и ограничений при выявлении новых аллелей. В работе рассмотрены аллельные варианты генов HLA, методы их секвенирования и анализа. Кроме того, сообщается об идентификации четырёх новых аллелей HLA в казахской популяции: DQB1*03:82, C*06:256, B*13:150 и A*32:95. Все четыре аллеля содержат несинонимичные замены в пептидсвязывающих доменах, что указывает на их возможную иммунологическую значимость. Сравнительный анализ показал, что технология NGS повышает эффективность обнаружения новых аллелей в 2,8 раза по сравнению с секвенированием по Сэнгеру (один новый аллель на 635 типирований против 1773). Полученные результаты демонстрируют значительное генетическое разнообразие HLA среди населения Центральной Азии, которое остается недостаточно представленным в международных базах данных. Выявление специфичных для популяции аллелей подчеркивает необходимость расширения HLA-профилирования в этнически разнообразных регионах для улучшения исходов трансплантации и развития персонализированной иммунотерапии.